一、計畫類別及申請人資格包括三類別，分述如下：

1. 新秀學者：計畫主持人須為國內外擔任教學、研究專任職務在5年以內或獲博士學位後5年以內者，其申請時擔任教學、研究專任職務資歷併計已超過5年之人員，不得申請。​申請時得不具科技部專題研究計畫主持人資格。每年核定補助新計畫以25件為原則，每件計畫每年補助經費以不超過新臺幣500萬元為原則。
2. ​優秀年輕學者：年齡在45歲以下(1977年1月1日以後出生)且​具備科技部專題研究計畫主持人資格者。每年核定補助新計畫件數及每件計畫每年補助經費依審查結果擇優核給。
3. ​國際年輕傑出學者：年齡在45歲以下且於國內外已具獨立研究資歷，及建立國際團隊等國際學術相關表現者。​申請時得不具科技部專題研究計畫主持人資格。每年核定補助新計畫以15件為原則，每件計畫每年補助經費以不超過新臺幣1,000萬元為原則。

二、​申請方式：

1. ​申請人已具科技部專題研究計畫主持人資格者，每人限提一件計畫。

2. 申請時未具科技部專題研究計畫主持人資格者，僅得申請「新秀學者」及「國際年輕傑出學者」，每人限提一件計畫，且須於取得資格後依徵求公告第8點規定函送相關文件，計畫始得核定執行。

三、申請人已具科技部專題研究計畫主持人資格者，經審查未達各該類補助標準者之後續作法：

1. ​「國際年輕傑出學者」或「新秀學者」：未申請 111 年度科技部專題研究計畫且 111 年 8 月 1 日後未執行科技部專題研究計畫者，得自科技部通知計畫未通過之日起一個月內，調整計畫規模後，以隨到隨審方式提出當年度專題研究計畫申請。
2. ​「優秀年輕學者」：得經審查轉為一般專題研究計畫申請案，並依其規定辦理。